货号 | 335112 |
简介 | 使用MethylScreen技术分析用户定义基因的DNA甲基化状态 |
描述 | Performance EpiTect Methyl II Custom PCR Arrays灵敏度高(参见"EpiTect Methyl II PCR Assay detects methylation in heterogeneous samples")。结果与亚硫酸氢盐测序的甲基化分析结果具有可比性(参见"Comparison with bisulfite Sanger sequencing"),非常适合基因组范围的甲基化分析研究验证(参见"EpiTect Methyl II PCR Arrays generate data comparable to that from BeadChip platforms")。EpiTect Methyl II Custom qPCR Arrays非常适合生物标记物的发现研究(参见"EpiTect Methyl II PCR Arrays discover new candidate breast cancer DNA methylation biomarkers")。Principle 基因表达过程中,DNA甲基化至关重要,以独有的CpG二核苷酸形式存在,即甲基残留与胞嘧啶残留共价结合。CpG岛是一个GC含量丰富和CpG二核苷酸高频出现的区域,与人类基因60–70%的启动子区域重叠。基因启动子CpG岛的超甲基化多数与基因沉默有关。 EpiTect Methyl II qPCR Array体系,配合MethylScreen技术,使用2个不同的限制性内切酶剪切靶序列,这些酶的活性要求在各自的识别序列中存在或不存在甲基化胞嘧啶。Real-time PCR确定限制性酶切后残留的DNA的量(参见"EpiTect Methyl II PCR Array procedure"),同时简单可靠计算单个基因的甲基化状态和对多个基因进行甲基化分析(参见"Pictorial explanation of results")。同时使用限制性酶切和PCR扩增,能够分析更少量、更多异源性的样本。 使用QIAGEN专有的生物信息学算法选择启动子CpG岛,可呈现最优的定制基因甲基化状态。严格的湿法PCR引物验证和质控生产确保CpG岛特异性分析具有高特异性和高扩增效率。配合RT2SYBR® Green qPCR Mastermix,EpiTect Methyl II Custom qPCR Arrays的检测性能具有可靠性。 EpiTect Methyl II Custom qPCR Arrays可同时进行基因启动子的DNA甲基化分析。提供96和384孔板两种规格,可分析至多24或96个相关研究领域基因的甲基化状态。只需选择所需基因和孔板规格(参见"EpiTect Methyl qPCR Array formats"),然后联系我们。 Procedure 首先,加入等量的基因组DNA样本到EpiTect Methyl DNA II Restriction Kit,构建四种不同的限制性酶切:模拟(Mo)、甲基敏感(Ms)、甲基依赖(Md)和双甲基敏感(Msd)。酶切和热灭活后,使用RT2 SYBR Green qPCR Mastermix混合酶切产物,等分至EpiTect Methyl II qPCR Array的相应孔中,在real-time PCR仪上运行推荐的循环程序即可。 使用仪器上的软件确定CT值,用于表征每个基因特异性分析的酶切产物。然后,将得到的值粘贴到符合芯片规格的Excel数据表格,计算超甲基化DNA百分比。 Applications EpiTect Methyl II PCR系列产品是创新的研究工具,用于:
此外,EpiTect Methyl II PCR Arrays也可配合RT2 Profiler PCR Arrays和Assays用于研究基因表达变化的调节机制。 |
说明书 |
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供应商 | Qiagen |