货号 | 1027421 | ||||||||||||||||||||||||||||||
简介 | 灵活经济的RNAi筛选工具 | ||||||||||||||||||||||||||||||
描述 | Performance 先进的siRNA设计QIAGEN在siRNA设计中的进步性,确保其高度创新且精良的HP OnGuard siRNA Design,能提供有效特异的siRNA。根据来自RNAi试验的数据建立极大容量的数据集,并在此基础上利用神经网络技术进行siRNAs设计,然后使用先进的、非冗余序列数据库和同源分析工具,检查该序列与同一基因组内其他序列的同源性。HP OnGuard siRNA Design具有许多独特先进的特性(见下表)。
3 UTR/seed区域分析研究表明siRNA反义链源区域与非目的靶标mRNA3’非编码区的匹配(见表),可能导致脱靶效应。siRNA双链的反义链上的2-7位是源区域,包括6个碱基。由于siRNA可模拟miRNA的作用,类似的匹配会促进非靶标mRNA的减少。使用QIAGEN设计的siRNA,与源自miRNA,siRNA和鼠RefSeq数据库的3’非编码区专利产品相配合,可对3’UTR/seed区进行分析研究。将每个siRNA与这些序列比对,检查任何可能导致miRNA类脱靶效应的同源序列。 siRNA源区域所有6个碱基与无关靶标3’非编码区序列完全匹配是常见情况,且无需除去这种siRNA。更罕见的是siRNA序列中出现源区域与10个或更多碱基同源匹配的情况,这种同源性很有可能导致脱靶效应,而这些siRNA可能因为与非靶标基因表现出更高的同源性而被弃用。 对于一些靶位点,很难选择到完全非同源性的siRNA。对于这种情况,非相关基因的EntrezGene ID可能是GeneGlobe提供的siRNA的非靶标基因。对这种类型同源性的关注并不意味这些基因一定会受到siRNA的影响,然而如有必要,后续分析中可以认定上述基因为潜在的非靶标基因。 Principle FlexiPlate siRNA通过筛查实验设计RNAi,以满足特定需求。可按需选择用于阳性和阴性对照的用于任意人类或鼠基因的siRNA使用FlexiPlate siRNA可设计RNAi筛选实验,满足不同需求。可选择任何人类或小鼠基因的siRNA以及所需的阳性或阴性对照。网页界面友好,可任意排列siRNA和其对照在96孔板或384孔板中的位置,或使用多种预设的排列方式设置孔板的位置。siRNA具有0.1 nmol、0.25 nmol或1 nmol的规格以供订购;可按需进行小量或大量siRNA筛查,节省开支。96孔板的规格包括0.1 nmol、0.25 nmol或1 nmol。384孔板的规格包括0.1 nmol或0.25 nmol。 Procedure 使用GeneGlobe数据库可方便的搜索您感兴趣的siRNA,并根据筛查实验设置孔板布局。可上传基因名称、Entrez Gene ID、RefSeq ID、siRNA名称或货号,快速方便实现孔板的订购,可立即订购或保存起以备后用。板式可下载到本地以供记录。 Applications FlexiPlate siRNA适用于多种RNAi应用:
|
说明书 |
| |
供应商 | Qiagen |