一抗

克隆类型
多抗单抗
产品类型
标签抗体磷酸化抗体内参抗体甲基化抗体乙酰化抗体药物与化合物抗体植物抗体
研究领域
肿瘤心血管细胞生物免疫学发育生物学染色质和核信号微生物学细胞凋亡信号转导干细胞神经生物学生长因子和激素糖尿病内分泌病转运蛋白植物细菌及病毒转录调节因子海洋生物上皮细胞趋化因子结合蛋白细胞表面分子G蛋白偶联受体胶原蛋白糖蛋白交换蛋白细胞分化血管内皮细胞细胞类型标志物内皮细胞淋巴细胞T-淋巴细胞B-淋巴细胞细胞粘附分子肿瘤细胞生物标志物骨髓细胞细胞骨架跨膜蛋白细胞因子自然杀伤细胞树突状细胞标志物脂蛋白新陈代谢锌指蛋白通道蛋白细胞周期蛋白激酶和磷酸酶昆虫线粒体环指蛋白细胞自噬细胞膜受体药物及化合物泛素干扰素G蛋白信号细胞膜蛋白Alzheimers表观遗传学细胞外基质合成与降解

标记一抗

标记类型
HRPBiotinGoldRBITCAPFITCCy3Cy5Cy5.5Cy7PEPE-Cy3PE-Cy5PE-Cy5.5PE-Cy7APCAlexa Fluor 350Alexa Fluor 488Alexa Fluor 555Alexa Fluor 594Alexa Fluor 647

二抗

克隆类型
多抗单抗
产品分类
二抗二抗血清

标记二抗

标记类型
HRPBiotinGoldRBITCAPFITCCy3Cy5Cy5.5Cy7PEPE-Cy3PE-Cy5PE-Cy5.5PE-Cy7APCAlexa Fluor 350Alexa Fluor 488Alexa Fluor 555Alexa Fluor 594Alexa Fluor 647

蛋白质与多肽

产品分类
蛋白质多肽

标记蛋白质与多肽

所有产品
全部标记蛋白质与多肽

正常动物血清及免疫球蛋白

产品分类
正常动物血清免疫球蛋白

试剂盒

产品分类
ELISA试剂盒

常用试剂

产品分类
免疫组化常用试剂免疫印迹常用试剂常用显色试剂细胞生物学试剂分子生物学生化试剂

亲和层析柱

所有产品
亲和层析柱

配套试剂

所有产品
常用配套试剂

ELISA试剂盒

人ELISA试剂盒 大鼠ELISA试剂盒 小鼠ELISA试剂盒 牛ELISA试剂盒 鸡ELISA试剂盒 植物ELISA试剂盒 猴ELISA试剂盒 猪ELISA试剂盒 山羊ELISA试剂盒 马ELISA试剂盒 仓鼠ELISA试剂盒 绵羊ELISA试剂盒 兔子ELISA试剂盒 犬ELISA试剂盒 豚鼠ELISA试剂盒 其他ELISA试剂盒

生化试剂

色素类 分离材料及耗材 维生素 染色剂 碳水化合物 植物激素及核酸 抗生素 蛋白质 氨基酸 测试盒 其他生物试剂 缓冲剂 表面活性剂

血浆

血浆

血清

Sigma胎牛血清 gibco胎牛血清 Hyclone血清 人血清 国产新生牛血清 国产胎牛血清 其他血清

细胞

其它细胞 仓鼠细胞 猴细胞 大鼠细胞 人细胞 狗细胞 小鼠细胞 猫细胞 鸡细胞

标准品

对照品 农药标准品 标准物质 食品 无机溶液标准物质 有机溶液标准物质

抗体

兔抗 鼠抗 IgY抗体 IgA抗体 IgG抗体 二抗 一抗

裂解血

裂解血

培养基

美国药典培养基 化妆品检验培养基 大肠杆菌、大肠菌群 金黄色葡萄球菌检验 消毒灭菌效果评价 临床检验用培养基 中华人民共和国药典 欧洲药典(EP) 饮用天然矿泉水检验方法 微生物检验 霉菌、酵母菌 肠球菌、链球菌 沙门氏菌、志贺氏菌 弧菌 弯曲杆菌 李斯特氏菌 产气荚膜梭菌 阪崎肠杆菌 乳酸菌、双歧杆菌 小肠结肠炎耶尔森氏菌 蜡样芽孢杆菌检验 小肠结肠炎耶尔森氏菌检验 一次性试管、液体培养基 乳酸菌检验 菌落总数测定、无菌检验 显色培养基 植物组培

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FlexiPlate siRNA Set 0.1 nmol / well

货号: 1027411 基本售价: 316.0 元 规格: EA

产品信息

概述
货号1027411
简介灵活经济的RNAi筛选工具
描述

Performance

先进的siRNA设计

QIAGEN在siRNA设计中的进步性,确保其高度创新且精良的HP OnGuard siRNA Design,能提供有效特异的siRNA。根据来自RNAi试验的数据建立极大容量的数据集,并在此基础上利用神经网络技术进行siRNAs设计,然后使用先进的、非冗余序列数据库和同源分析工具,检查该序列与同一基因组内其他序列的同源性。HP OnGuard siRNA Design具有许多独特先进的特性(见下表)。

HP OnGuard siRNA Design特性
特性描述参考
神经网络技术使用BioPredsi神经网络设计siRNA,依托于极大的RNAi数据库。1-3
全球最大的siRNA验证项目该项目提供的数据使设计过程更完善,QIAGEN科学家已通过成千上万的siRNA确认其效能。该项目证实大量药用基因组siRNA功能至少有70%可被抑制。4
同源性分析该分析使用专用工具以及最新的,非冗余序列数据库。
Affymetrix基因芯片分析基因组范围siRNA设计的创新性发展最大程度减少脱靶效应。
最新的siRNA靶序列NCBI数据库的最新数据确保设计的准确性。
不对称性对siRNA的设计基于5’端碱基对的不等稳定性,使得有义链被降解的同时,反义链在5’端的结合度降低而进入RISC。利用不对称性可制备高度可用的siRNA,且大大降低了错误链进入RISC而导致脱靶效应的风险。5,6
3 UTR/seed区域分析使用智能加权分析,多参数搜索与非目的靶标mRNA3’非编码区相匹配的siRNA反义链的源区域。7-12
SNP位点屏蔽采用RefSNP数据库排除单核苷酸多态(SNP)的siRNA,由于这种siRNA有效性不同从而提高了siRNA的效果。
干扰素序列屏蔽屏蔽掉可导致干扰素反应的多重序列基序siRNA,弃用含有这种基序的siRNA。13,14
1. Huesken, D. et al. (2005) Design of a genome-wide siRNA library using an artificial neural network. Nat. Biotechnol. 23, 995.
2. Mukherji, M. et al. (2006) Genome-wide functional analysis of human cell-cycle regulators. Proc. Natl. Acad. Sci. 103, 14819.
3. Matveeva, O. et al. (2007) Comparison of approaches for rational siRNA design leading to a new efficient and transparent method. Nucleic Acids Res. 35, e63.
4. Krueger, U. et al. (2007) Insights into effective RNAi gained from large-scale siRNA validation screening. Oligonucleotides 17, 237.
5. Aza-Blanc, P. et al. (2003) Identification of modulators of TRAIL-induced apoptosis via RNAi-based phenotypic screening. Mol. Cell 12, 627.
6. Schwarz, D.S. et al. (2003) Asymmetry in the assembly of the RNAi enzyme complex. Cell 115, 199.
7. Farh, K.K. et al. (2005) The widespread impact of mammalian microRNAs on mRNA repression and evolution. Science 310, 1817.
8. Grimson, A. et al. (2007) MicroRNA targeting specificity in mammals: determinants beyond seed pairing. Mol. Cell 27, 91.
9. Jackson, A.L. et al. (2003) Expression profiling reveals off-target gene regulation by RNAi. Nat. Biotechnol. 21, 635.
10. Lewis, B.P., Burge, C.B., and Bartel, D.P. (2005) Conserved seed pairing, often flanked by adenosines, indicates that thousands of human genes are microRNA targets. Cell 120, 15.
11. Lim, L.P. et al. (2005) Microarray analysis shows that some microRNAs downregulate large numbers of target mRNAs. Nature 433, 769.
12. Saxena, S., Jónsson, Z.O., and Dutta, A. (2003) Small RNAs with imperfect match to endogenous mRNA repress translation. Implications for off-target activity of small inhibitory RNA in mammalian cells. J. Biol. Chem. 278, 44312.
13. Judge, A.D., Sood, V., Shaw, J.R., Fang, D., McClintock, K., and MacLachlan, I. (2005) Sequence-dependent stimulation of the mammalian innate immune response by synthetic siRNA. Nat Biotechnol. 23, 457.
14. Hornung, V. et al. (2005) Sequence-specific potent induction of IFN-alpha by short interfering RNA in plasmacytoid dendritic cells through TLR7. Nat Med. 11, 263.
3 UTR/seed区域分析

研究表明siRNA反义链源区域与非目的靶标mRNA3’非编码区的匹配(见表),可能导致脱靶效应。siRNA双链的反义链上的2-7位是源区域,包括6个碱基。由于siRNA可模拟miRNA的作用,类似的匹配会促进非靶标mRNA的减少。使用QIAGEN设计的siRNA,与源自miRNA,siRNA和鼠RefSeq数据库的3’非编码区专利产品相配合,可对3’UTR/seed区进行分析研究。将每个siRNA与这些序列比对,检查任何可能导致miRNA类脱靶效应的同源序列。

siRNA源区域所有6个碱基与无关靶标3’非编码区序列完全匹配是常见情况,且无需除去这种siRNA。更罕见的是siRNA序列中出现源区域与10个或更多碱基同源匹配的情况,这种同源性很有可能导致脱靶效应,而这些siRNA可能因为与非靶标基因表现出更高的同源性而被弃用。

对于一些靶位点,很难选择到完全非同源性的siRNA。对于这种情况,非相关基因的EntrezGene ID可能是GeneGlobe提供的siRNA的非靶标基因。对这种类型同源性的关注并不意味这些基因一定会受到siRNA的影响,然而如有必要,后续分析中可以认定上述基因为潜在的非靶标基因。

Principle

FlexiPlate siRNA通过筛查实验设计RNAi,以满足特定需求。可按需选择用于阳性和阴性对照的用于任意人类或鼠基因的siRNA使用FlexiPlate siRNA可设计RNAi筛选实验,满足不同需求。可选择任何人类或小鼠基因的siRNA以及所需的阳性或阴性对照。网页界面友好,可任意排列siRNA和其对照在96孔板或384孔板中的位置,或使用多种预设的排列方式设置孔板的位置。siRNA具有0.1 nmol、0.25 nmol或1 nmol的规格以供订购;可按需进行小量或大量siRNA筛查,节省开支。96孔板的规格包括0.1 nmol、0.25 nmol或1 nmol。384孔板的规格包括0.1 nmol或0.25 nmol。

Procedure

使用GeneGlobe数据库可方便的搜索您感兴趣的siRNA,并根据筛查实验设置孔板布局。可上传基因名称、Entrez Gene ID、RefSeq ID、siRNA名称或货号,快速方便实现孔板的订购,可立即订购或保存起以备后用。板式可下载到本地以供记录。

Applications

FlexiPlate siRNA适用于多种RNAi应用:

  • 通路分析
  • 大规模RNAi筛选的后续实验
性能
说明书
For transfection of eukaryotic cells with siRNA and miRNA
供应商Qiagen